磷酸化蛋白质组
翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，在生命现象的许多关键调节机制中，蛋白质的磷酸化是重要的翻译后修饰，它与信号传导，细胞周期，生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题有密切关系。
SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。
2D + MALDI-TOF/TOF蛋白胶点鉴定服务
利用MALDI-TOF/TOF技术对双向电泳中指定的胶点（考染、银染或DIGE）或单一纯化蛋白样品进行质谱鉴定。
蛋白样本制备、免疫组化、双向电泳、蓝色温和胶电泳系统分离蛋白质复合体、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹及磷酸化蛋白质检测
北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台可承接单项的蛋白质组学技术服务, 同时平台也开展规模化、高通量的蛋白质组学委托科研服务。
蛋白质谱鉴定服务
ThermoFinnigan公司的LTQ Orbitrap将轨道阱分析器和 Finnigan 的线性离子阱分析器融合在一起，我们使用高分辨多维色谱与离子阱质谱联用仪为客户提供高质量的蛋白质谱鉴定服务。
蛋白质组学Label Free分析服务
蛋白质非标记定量技术（label-free）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，即可对肽段对应的蛋白质进行相对定量。