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3. 蛋白质组学中的质谱技术——肽序列标签技术（PST）:由于PMF鉴定结果的可靠性受诸多因素影响，使得部分鉴定结果往往不是十分明确，特异性不高。多肽氨基酸序列匹配被认为是特异性最好的鉴定方法。在蛋白质组学研究中，利用质谱测序一般采用两种方式：一种是利用串联质

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多肽指纹图谱系统以MALDI TOF/TOF质谱系统为基础，把样品分离、质谱分析和生物信息学相结合，为差异蛋白的发现提供了新的途径。方案简单、重复性强、通量高，分离低丰度蛋白效果尤其显著。

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6． 蛋白质样品的质谱定性定量分析，突变位点鉴定，精确分子量测定，甲基化、乙酰化、磷酸化和糖基化等翻译后修饰的鉴定，质谱组织成像，使用仪器包括MALDI-TOF、MALDI-TOF/TOF

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非标记定量蛋白质组分析技术

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与植物和动物代谢组学相比，微生物在生长培养基中浓度较低，具有低浓度代谢物难于检测，胞内和胞外代谢物不易分离等特点。

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主要应用:1、生物大分子的分子量精确测定2、蛋白质的肽质量指纹图谱检测3、已知蛋白质的高通量检测鉴定4、未知蛋白的部分或全序列分析5、蛋白质/多肽的二硫键定位分析

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